在来種・固定種・交配種（F1種）と
自然農法交配種

種子は「有機か有機でないか」のほか、その種子の育種方法等によっていくつかの種類に分けられます。
伝統的に各地域で栽培されてきた「在来種」、在来種ではないが何代も栽培され種が固定された「固定種」、また交配によってそれぞれの種の長所を引き出した「交配種（F1種）」などがあります。
近年ではバイオ技術を使った「遺伝子組み換え種（GM）」「ゲノム編集種」や、放射線照射により突然変異を誘発する「放射線育種」「重イオンビーム育種」などさまざまな育種方法も開発されています。
それぞれに特徴や利点、課題・懸念点があり、有機栽培や家庭菜園に使いやすいものやそうでないもの、また持続可能な有機農産物の生産に適したものやそうでないものなどがあると考えます。しっかりと知ることで、正しいものを選ぶ知識と知恵を身につけることが大切です。

在来種とは

京野菜や下仁田ネギ、練馬大根など、特定の地域で長い年月をかけて受け継がれてきた品種のことで、その土地の気候や風土に適応した個性豊かな特徴を持ちます。味や形に地域性が表れやすく、食文化や生物多様性を守る上で重要な存在といえます。近年では地産地消の浸透とともに地域特産のブランド野菜としても注目を集めています。
一方で、現代的な商業栽培品種（交配種など）と比べると収量が安定しないという課題点もあります。また、種を保存し維持する技術が必要なため、農家の負担が大きくなることもあります。

固定種とは

何世代も世代を重ねて栽培されているうちに遺伝特性が安定した品種のことで、自家採種をすることで、翌年以降も同じ特徴を持つ作物を生産できる点や、在来種同様に地域性や多様性が生まれやすいことも特徴です。多くの在来種も固定種で丹波の黒豆や小豆などがその代表例です。
オーガニックと相性が良いことも特徴ですが、現代的な商業栽培品種（交配種など）と比べると収量や均一性で劣る場合があり、大量生産向きではないという課題点もあります。

交配種（F1種）とは

生物学用語でFirst Fillial Generation。別名ハイブリッド種ともいいます。異なる親品種の掛け合わせ（交配）種で、メンデルの法則を利用して優秀な種を作り出した一代雑種をさします。
おもに商業栽培向けに開発されるため、生育期間や形質、流通適性や、その時代や国・地域で受け入れられやすい食感・味・香りを目的にしたものが多くさまざまな品種の野菜が開発されています。生産・流通効率が高く商業栽培に広く利用されています。
一方で、次世代では同じ性質が再現されにくいため、毎年種を購入しなければならず、遺伝的多様性が低くなることで特定の病気に弱くなるなどのリスクもあります。また、掛け合わせの方法によっては雄性不稔（雄しべがでない劣性遺伝を有する親株）や植物の生理現象を利用するなど、突然変異や劣性遺伝（雄性不稔）の利用や、自然環境下とは異なる交配を人為的に行っているという懸念点もあります。

自然農法交配種（F1種）について

自然農法交配種（F1種）は味や草勢、耐病性に優れたものを選抜採種しています。もちろん雄性不稔、遺伝子組み換え、ゲノム編集、突然変異育種といった技術は使用しておりません。
F2世代でも個々の形質は異なる可能性はありますが、極端に弱い株が出現することもなく生育に大きなバラつきは出てきません。元の親が強い事で、なお一層F1種として強さが現われます。
もちろんどの種子も自家採種出来ます。だから自分の好みの物を選んで残すという楽しみ方も可能です。
自然農法交配種はいわば自然農法農家の長年の技術の結晶であり、まさに家庭菜園初心者にぴったりの「元気でおいしく、自家採種が可能な品種の種子」だと言えます。

ナチュラルライフ ステーションでは「有機」「オーガニック」の本質的な概念や、持続可能な有機農業に適していると考えられる「在来種」「固定種」「自然農法 交配種（F1種）」にこだわり商品をセレクトしています。

このほかにも近年の科学技術の進歩によりさまざまな育種方法が開発されています。
「遺伝子組み換え種（GM）」「ゲノム編集種」や、放射線照射により突然変異を誘発する「放射線育種・重イオンビーム育種」がそれにあたります。
ナチュラルライフ ステーションでは「有機」「オーガニック」の本質的な概念にそぐわない、という解釈により、これらの種子の取り扱いはいたしません。

遺伝子組み換え種・ゲノム編集種

遺伝子組み換え種（GM）とは

異なる生物の遺伝子（外来遺伝子）を組み込んだ、自然の交配では得られない特性をもった品種です。害虫抵抗性や除草剤耐性など、生産効率を高める特徴を持つ場合が多く、農薬や化学合成肥料などとの組み合わせにより開発・販売されていることが多いです。
国や地域によっては消費者の不安や不信感が根強く、特許や種子の所有権を巡る議論も続いています。また、生態系への影響や長期的な安全性に関する議論・検証が尽きていない点も課題といえます。

ゲノム編集種

DNAの特定部位を精密に切断・改変する技術を用いて作られた品種で、外来遺伝子を導入せずに特定の性質を改良できる点が特徴です。病害虫耐性や品質向上などの品種改良を短期間で実現できるため世界中で利用が進んでいます。
一方で、消費者への理解が十分に広がっていないことや、国ごとに規制や表示ルールが異なることが課題となっています。改変痕跡の検出が難しいことや、オフターゲット変異（意図しないDNA部位の切断・改変）に関する科学的議論も完全に解消されているわけでもない点も課題といえます。

放射線育種

ガンマ線などの放射線を照射して突然変異を起こし、その中から有用な特性を持つ個体を選抜する方法です。
日本を含め世界中で多くの品種が実用化されており、外来遺伝子を組み込まないためGMOには分類されません。
短期間で多様な変異を得られるという利点がある一方、できあがった変異は偶然性が大きく、目的の性質が得られないこともあります。また、意図しない複数の変異が同時に生じるため、開発・生産や品種特性、安全性の評価も簡単ではありません。
また遺伝子組み換え種（GM）やゲノム編集種との線引きや表示区分が曖昧なことも大きな課題です。

重イオンビーム育種

放射線育種の一種。より高エネルギーの重イオンを用いることで、多様かつ精密な突然変異を生み出すことができる技術です。日本はこの分野で世界をリードしており、短期間で新品種が生まれるケースも少なくありません。（コシヒカリ環１号が有名）
大型の加速器など高価な設備を必要とし、技術者や研究機関が限られている点が課題で、得られた変異を解析して品種として安定させるために膨大な時間と労力、コストが必要となります。
あくまで変異はランダムで精密性には限界があります。
通常の放射線育種同様に、開発・生産や品種特性、安全性の評価は簡単ではありません。